小怪物的死相很难看，但陈平却毫不介意，陈源脚一拿开，他就眉开眼笑地上去拎着它的一只前爪，将小怪物的尸体拎在手里，啧啧地赞叹着仔细打量。不是用手指敲敲它的鳞甲。正享受短暂假期的公AN九课少校草薙素子（坂本真绫 配音）突然接到巴特（松田健一郎 配音）的报告，西之内某处大厦遭受恐怖分子袭击，Z府高官和商业巨擎被人杀害。在草薙的指挥下，九课的石川、波玛、帕兹、巴特等人通力合作，将恐怖分子彻底制服，但草薙在行动中意外受到神秘病䓯感染。在西之内恐怖袭击的同时，远郊的水坝发生爆炸案。新滨县刑警陀古萨（新垣樽助 配音）传唤水坝管理企业负责人沙特博士，对方是来自饱经战火的卡森共和国的卡尔迪斯人。受警方高层施压，陀古萨没有得到任何有用信息。另一方面，草薙一方得知恐怖分子的真实身份，正是卡尔迪斯的游击队组织。两起案件意外联系在一起，其背后隐藏怎样的真相？ 本片根据士郎正宗的原作改编，为攻壳机动队前传“ARISE”的第三部。
